CY叠氮活性染料标记反应： NHS ester和带NH2的蛋白、高分子和药物分子连接 maleimide和带SH的蛋白、高分子和药物分子或生物分子连接 amine和带NHS的蛋白、高分子和药物分子或小分子连接 叠氮和带炔基的蛋白、高分子和小分子 TZ可以和带TCO反应
花菁( Cyanine，简称Cy)染料是合成染料的一种，相对而言，花菁染料的合成方法简单， 并且染料的颜色及荧光可以调节，因此使用范围极为广泛，在能源、 信息存储、高能物理、环境及生物医药领域都能见到花菁染料的身影。
花菁类荧光探针是在菁染料基础上发展的一种荧光探针，一般的荧光菁染料都包含两个氮原子杂环核为中心，通过多个次亚甲基（－CH＝，定义为甲川）组成， 中间有奇数个碳原子，键长均匀分布，整个分子形成一个大的 D-π-A 共轭体系。
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硅基罗丹明SIR（silicon rhodamine）染料是一种深红色近红外荧光染料、细胞渗透性强、高特异性的DNA探针。具有优异光物理性质、良好的生物相容性，在保留了罗丹明荧光染料优越的光学性质的同时，光谱发生明显红移，满足了近红外荧光检测的要求，其激发波通常长大于600 nm，发射波长位于近红外区约680 nm。
菁染料是一种能使感光材料增加感光性的染料，常见的有多甲川花菁染料（CY）和吲哚菁绿（ICG）。
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BODIPY 的光谱峰宽比较窄，使得染料具有非常高的灵敏度，即使待测样品溶度低也可以表现出显著的荧光变化，对光的感应度很高，荧光染料的光稳定性能非常优越，分子的荧光量子产率非常高，一般都能达到0.6。正因为氟化硼二吡咯（BODIPY）类荧光染料上述的这些优点，所以该染料非常适用于荧光光谱分析以及生物标记检测领域.
花菁染料的物质CY3、CY5均是常用于分子标记的荧光标记试剂，此类物质由于荧光强度高、稳定性强，用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。
