Cy系列荧光染料常见的有：非磺化Cy染料和磺化Cy染料（sulfo-Cy）。这两类染料有相同的骨架结构，所以它们具有几乎一样的荧光谱图和荧光灵敏度，在大多数情况下可以交换使用
磺酸基花菁染料CY5羧酸 Sulfo-Cy5 COOH激发发射646/670 皮下组织观测Sulfo-Cy5 COOH染料 磺化菁5染料Cy5 COOH
Cyanine3 dye azide可以用于点击化学，是Cy3 azide的类似物。Cy3 是使用的荧光素之一，因为它可以被各种不同的荧光计、成像仪和显微镜检测到
最近经常接到客户留言，我想标记化合物、聚合物、蛋白,你家有CY染料吗？又或者我的预算不够，FITC你们可以标记吗？？
Cyanine5.5 NHS 酯是一种活性染料，用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基，有较低的水溶性，可溶于DMSO、DMF、二氯甲烷等有机溶剂。
大多数非磺化花青的衍生物（酰肼和胺的盐酸盐除外）的水溶性都很低，当这些分子用于生物分子标记时，为了能够有效的发生反应，必须使用有机助溶剂（DMF或DMSO的5-20％）。 首先将花青染料溶解在有机溶剂中； 然后在适当的极性缓冲液中稀释再使用。
Cy5 NHS ester 是用于标记肽、蛋白质和核苷酸中的氨基的活性染料。这种染料需要少量的有机共溶剂（如DMF或DMSO）用于标记反应。该试剂是非常可贵的有效标记的可溶性蛋白以及各种肽和核苷酸的试剂。
Cy染料和磺化Cy染料（sulfo-Cy）相比，这两类染料有相同的骨架结构，因此它们具有几乎一样的荧光谱图和荧光灵敏度，在大多数情况下可以交换使用。
CY系列花菁染料大多属于近红外荧光染料它们的吸收和发射光谱区位于550-1200nm处,在这个光谱区域，玻璃、聚丙烯酰胺凝胶基质和生物化学杂质的荧光背景都很弱，信噪比很高，而且它们有着很高的摩尔吸光系数和良好的荧光特性，因此荧光检测的灵敏度很高。
