荧光主要的激发光与发射光谱主峰之间的差异称为stokes shift（斯托克位移）, 常见的stokes shift不超过几十纳米。实验中分子发荧光：先要吸收光能，使电子跃迁到较高能级或激发态，当电子释放部分或全部光能时，就会发出荧光。失去的激发能是非辐射性的，失去的能量低于吸收的能量。
星戈瑞荧光stargraydye提供花菁染料、罗丹明、BDP、荧光素、近红外一区/二区染料、荧光探针、荧光标记蛋白/糖等。以下小星简述如何选择合适的荧光染料：
1、 确定荧光染料本身所适合的流式细胞仪，需要了解染料的激发波长和发射波长、仪器所配制的检测滤光片和激发光源。
2、 了解荧光素的相对荧光强度：相对荧光强度反映的是荧光素-单抗结合物的亮度，其判断标准是染色指数。
影响相对荧光强度的因素包括：不同仪器的激光及滤片组合不同，荧光素的相对荧光强度不同；抗体上荧光素分子的多少会影响相对的荧光强度。
3、 选择原则：
（1） 考虑抗原的密度：高密度表达的抗原可考虑选择几乎所有的荧光素；低密度表达的抗原需要可提供较高S/N比值的荧光素，如PE/APC。；
（2） 自发荧光：每种细胞群都有不同水平的自发荧光，所有的荧光通道均可观察的自发荧光，但自发荧光强度在波长较长时迅速降低。对自发荧光较强的细胞，选择发射波长长的荧光素（APC）可得到较好的S/N比值，对于自发荧光强度弱的细胞，发射波长长的荧光素对S/N提高没有明显的改善，可选用FITC。
（3） 非特异性结合复合染料：避免信号衰退。复合染料因为光、固定剂或温度升高会导致信号衰退，使复合染料在上一级染料处发光。
减少样本暴露于光、高温或固定剂，可很大程度上避免这一问题。若样本需要固定，要选择稳定的固定剂，可有效阻止复合染料的信号衰退。尽量减少信号间的干扰，检测的颜色越多，面临的信号干扰越多，选择试剂时尽可能降低荧光发射波长间的重叠。
