氟硼荧光染料是一种新型的荧光化合物，其具有优良的光学性质和生物相容性。在生物体内能稳定存在，容易进行修饰，常用于标记蛋白质和DNA中。氟硼荧光染料可分为氟硼二吡咯(BODIPY)和氮杂氟硼二吡咯(Aza-BODIPY)两种，他们也有不同的特点。
氟硼二吡咯（BODIPY）又叫氟硼二吡咯亚甲基和氟硼二吡咯甲川，它的荧光量子产率高、摩尔消光系数高、发射信号稳定、易于修饰、对溶剂的极性和pH敏感性低等特性被用于有机小分子荧光探针的构建；它的荧光寿命长、发射半峰宽窄等特点在荧光探针、生物成像等多个领域被更好的研究和应用；与此同时，它的摩尔消光系数高，光化学稳定性强，结构易修饰及刚性共轭等特点，赋予了BODIPY单元构筑高效有机光伏材料的潜力。但是，简单的BODIPY不溶于常见的水性溶剂。
氮杂氟硼二吡咯（aza-BODIPY）是一类在长波长区域有强烈吸收的染料分子，其具有较长的吸收波长、高的吸光度系数和优异的光稳定性等特点被用于抑制剂和光敏剂也可形成J-聚集体等。
