荧光标记法
是把利用荧光蛋白或荧光蛋白基因作为特定的标志物对研究对象物体进行标记的分析方法。荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物，受到紫外光或蓝紫光照射时，可激发成为激发态，当从激发态恢复基态时，发出荧光。
荧光标记技术
指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染，操作简便等优点，使得荧光标记物有较广的应用。
荧光标记的作用
荧光标记物质在蛋白的功能研究、药物筛选等领域也有着广泛的应用。人们利用利用荧光标记的多肽来检测目标蛋白的活性，并将其发展的高通量活性筛选方法应用于疾病治疗靶点蛋白的药物筛选和药物开发（例如，各种激酶、磷酸酶、肽酶等）。因此，多肽的荧光修饰，同样是多肽合成领域的重要内容。
荧光标记的位点
荧光标记物质可以直接和多肽的N端直接相连（如异硫氰酸荧光素的连接， 通常在多肽的N端和异硫氰酸荧光素直接插一个氨基乙酸或者β-丙氨酸。），或者在C端和赖氨酸（或半胱氨酸）的侧链连接、或者在其它可以连接的位子连接。
