吡咯硼(BODIPY)是以硼二吡咯(boron-dipyrromethene)为荧光结构母核的一类新型的荧光染料，其主要特点是结构非对称性，使得BODIPY衍生物拥有更多应用范围。相对于常见的荧光素类、花菁类、罗丹明类等荧光染料相比，BODIPY类具有高荧光量子产率、高摩尔消光系数、良好的光稳定性、对pH不敏感等优点。
BODIPY FL是一种简单的硼二吡咯染料，FL为Fluorecein(荧光素)的首二字母，意思为其荧光类似荧光素。BODIPY FL激发后发明亮的绿色荧光，与荧光素，罗丹明绿，AF488等染料类似。它量子产率和消光系数很好，并且荧光属性对溶剂的极性，pH及溶剂种类不敏感，属荧光属性极稳定的一类绿色染料。BODIPY FL分子结构中性，不带电荷，整个染料分子较疏水，可透过细胞膜，常用于透膜性荧光探针(比如LysoTracker Green)。BODIPY FL的荧光寿命较长，可用于荧光极化类(fluorescence polarization)检查实验。
BODIPY R6G发黄色荧光，类似于罗丹明6G（简称R6G）。BODIPY R6G量子产率，消光系数，荧光稳定性很好，并且荧光属性对溶剂的极性，pH及溶剂种类不敏感。BODIPY R6G分子中性，不带电荷，分子量较小，较疏水，可透过细胞膜，常用于透膜性荧光探针，标记细胞膜，磷脂等。BODIPY R6G也可以用来标记蛋白，多肽，纳米粒等生物材料，用于荧光显影，荧光极化(fluorescence polarization)检查，双光子实验等。
