水溶CY5-NHS Ester，全称为Sulfo-Cyanine5 NHS Ester，是一种在生物医学和生命科学研究中应用的荧光标记试剂。其化学结构和光谱特性使其成为标记蛋白质、核酸等生物分子的选择。
化学结构
水溶CY5-NHS Ester的化学结构主要由两部分组成：Cy5荧光染料和NHS酯（N-hydroxysulfosuccinimide ester）基团。Cy5荧光染料是一种常用的近红外荧光染料，以其荧光性能和稳定性著称。NHS酯基团则是一种活泼的官能团，能够与目标分子中的氨基或羟基发生反应，形成稳定的酰胺或酯键，从而实现荧光标记的目的。
具体来说，水溶CY5-NHS Ester的结构中包含了一个带有负电荷的磺酸基团（Sulfo-），这使得该化合物具有良好的水溶性和生物相容性。此外，它还包含两个苯丙烯基团和一个琥珀酰亚胺基团，这些结构特征共同决定了其独特的化学性质。
光谱特性
激发波长与发射波长：水溶CY5-NHS Ester的激发波长通常在646-650nm之间，发射波长则在662-670nm范围内。这种长波长的光谱特性使得该荧光染料在红色光区域发射强烈的荧光，尤其适用于深层组织或厚样本的成像。同时，其近红外发射光谱特性还减少了生物组织自然荧光和散射的干扰，提高了成像的清晰度和深度。
荧光量子产率：水溶CY5-NHS Ester具有较高的荧光量子产率，即在吸收光子后转化为荧光光子的效率较高。这使得用该染料标记的样本能够产生强烈的荧光信号，提高实验的灵敏度和准确性。
光稳定性：水溶CY5-NHS Ester具有较高的光稳定性，即使在连续激发下也不易发生光漂白。
应用领域
生物标记：该化合物可以与抗体、蛋白质、核酸等生物分子共价结合，形成荧光探针。这些探针可用于跟踪和可视化特定生物分子在细胞或组织中的位置和分布，从而研究细胞过程和生物分子的功能。
细胞成像：水溶CY5-NHS Ester适用于活细胞成像和固定细胞成像。其近红外发射光谱特性使得成像过程能够深入组织内部，减少自发荧光的干扰，为研究细胞结构和功能提供工具。
免疫分析：该荧光染料可用于各种免疫分析技术，如免疫印迹、流式细胞仪分析和免疫组化。它作为标记物可以检测和定量分析特定抗原或蛋白质在生物样品中的存在。
荧光定量PCR：水溶CY5-NHS Ester在荧光定量PCR（qPCR）中作为荧光探针，用于检测和定量核酸序列。这一应用有助于基因表达分析和病原体检测等研究。
药物传递研究：该荧光染料还可用于药物传递研究，追踪和评估药物在体内的分布和释放情况，为药物研发提供数据支持。
水溶CY5-NHS Ester凭借其独特的化学结构和光谱特性，在生物医学和生命科学研究中展现出诸多应用前景。其良好的水溶性、高荧光量子产率以及光稳定性等特点，使其成为标记生物分子、进行细胞成像和免疫分析等研究的工具。
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