蛋白标记的主要目的是监测生物过程、辅助检测（例如化合物的可靠定量、蛋白质修饰的特异性检测）或者纯化标记后的蛋白及其结合对象。蛋白质的标记能够提高检测灵敏度以及简化检测工作流程。
荧光蛋白标记：
将目的蛋白与荧光蛋白融合，则能够实现目的蛋白的细胞内观察，可用于多色标记和荧光共振能量转移（FRET）应用，用于可视化蛋白质与其他亚细胞结构的易位，研究蛋白质-蛋白质共定位，检测来自不同启动子的基因表达的开始，以及混合细胞群的分离。从早期的绿色荧光蛋白GFP发展到现在，已有多种光谱区域的荧光蛋白，包括绿色荧光蛋白、蓝色和蓝绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、橙色荧光蛋白、红色荧光蛋白，不同光谱型的荧光蛋白在亮度、光稳定性、分子大小上有所不同。
星戈瑞荧光stargraydye荧光标记蛋白：
【荧光标记的组蛋白】：
FITC-Histone
Rhodamine-Histone
CY3-Histone
CY5-Histone
CY5.5-Histone
CY7-Histone
CY7.5-Histone
ICG-Histone
【荧光标记血红蛋白】：
Hemoglobin-CY5
Hemoglobin-CY3
Hemoglobin-CY5.5
Hemoglobin-CY7.5
Hemoglobin-CY7
Hemoglobin-Biotin
Hemoglobin-SH
Hemoglobin-TRITC
Hemoglobin-FITC
【荧光标记粘蛋白】：
Mucin-CY5
Mucin-CY3
Mucin-CY5.5
Mucin-CY7.5
Mucin-CY7
Mucin-Biotin
Mucin-SH
Mucin-TRITC
Mucin-FITC
【荧光标记肌红蛋白】：
Myoglobin-CY5
Myoglobin-CY3
Myoglobin-CY5.5
Myoglobin-CY7.5
Myoglobin-CY7
Myoglobin-Biotin
Myoglobin-SH
Myoglobin-TRITC
Myoglobin-FITC
【荧光标记核仁蛋白】：
Nucleohistone-CY5
Nucleohistone-CY3
Nucleohistone-CY5.5
Nucleohistone-CY7.5
Nucleohistone-CY7
Nucleohistone-Biotin
Nucleohistone-SH
Nucleohistone-TRITC
Nucleohistone-FITC
