将Cy5 NHS置于溶液中可观察到荧光染料的荧光，这是因为Cy5 NHS具有较强的光吸收和荧光强度。而荧光染料则是在受到荧光染料基团或分子的激发后，其激发光（光）经过一个完整的荧光路径而不是之前受到激发。
溶剂的性质对荧光物质的荧光强度有明显的影响。通常荧光物质的荧光强度随着溶剂极性的增强而增大，荧光峰的波长随着溶剂介电常数增大而增大。
荧光染料是指吸收某一波长的光波后能发射出另一波长大于吸收光的光波的物质。它们大多是含有苯环或杂环并带有共轭双剑的化合物。荧光染料可以单独使用，也可以组合成复合荧光染料使用。
Cy染料作为常用的近红外荧光染料在多种实验方向均有应用，尤其CY7等染料它也因其特性多应用于成像染料。那在近红外成像研究方面Cy染料（菁染料）的那些特性/优点呢??
磺化Sulfo Cy7-NHS磺酸CY7标记活性脂活化酯的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。
五甲川菁染料的光稳定性介于三甲川菁染料和七甲川菁染料之间， 光照条件下容易发生光漂白，其中CY5-NHS活性酷可以与蛋白质的氨基（主要是侧链的赖氨酸残基）在温和条件下反应形成共价的蛋白质和染料的复合物。
目前文献报道的荧光探针种类有很多，而其中只有花菁类荧光团处于近红外窗口波长范围。花菁类荧光团的优势在于近红外区域（约650-900nm）的光较难被生物分子吸收，因此可以穿透组织。该区域的自荧光也较少，这有利于体内成像。
（1）荧光基团（Fluorophore）：当识别基团和目标分析物相互作用时能够引起化学环境的变化。而荧光基团能将这种变化转化为仪器能够探测的信号或者是人所能感知的信号。例如：光谱变化或者颜色的改变等。
荧光探针都会包括荧光团、连接体和识别团三个部分。识别团可以选择性的与检测物结合，从而改变探针的化学环境，它决定了分子探针的选择性与特异性。CY7-amine/CY5-COOH/Cy3-MAL
