不管是肽还是蛋白，都没有颜色的，需要提前给多肽或者蛋白标记上荧光物质。比如上期提到的Cy系列菁染料、FITC、RB等。
多肽荧光标记和蛋白荧光标记有什么区别呢？
1、 在精准标记上有所不同。
2、 荧光分子的使用量不同。
3、 标记后的环境纯化不同。
关于精准标记：
多肽荧光标记通常在多肽合成过程中标记。此时其他所有活性基团均被保护起来，所以多肽的荧光标记是非常精准的定点标记。
蛋白的荧光标记是非定点标记的，也称随机标记。通常一个蛋白分子中会有很多个氨基，巯基，或者其他基团。
荧光染料与蛋白分子的氨基结合，因为氨基的数量不是唯一的，所以蛋白分子和荧光基团会出现很多种组合，最终产物肯定是分子结构不单一的混合物。
（不过在一些实验研究中，这个因素可以忽略，只要蛋白分子被标记上荧光基团就行，而不在乎荧光基团标记在哪个位点。）
关于荧光分子使用量：
多肽荧光标记中，通常其荧光分子的使用量是蛋白标记使用量的数十倍，甚至百余倍，例如想拿到5mg 95%荧光标记的多肽，至少需要200mg或300mg荧光分子。
蛋白荧光标记可采取等摩尔量的投料比，荧光分子的用量可能只有几毫克。
所以受荧光分子原料的价格限制，多肽荧光标记的种类很少，常见的就FAM、FITC、TAMRA、Rhodamine B等。
标记后的环境纯化不同：
多肽荧光标记之后，通常会采用高浓度三氟乙酸处理，处于强酸环境中，然后通过HPLC纯化。
蛋白荧光标记后的处理就温和多了，可可直接通过透析、超滤、脱盐柱或HPLC纯化。
星戈瑞stargraydye分享科研用材料。（2023.2）
