荧光染料,由于灵敏度高,操作方便,逐渐取代了放射性同位素作为检测标记,其常应用于荧光免疫,荧光探针,细胞染等。包括特异性DNA染色,用于染色体分析、细胞周期、细胞凋亡等相关研究。
短波区域的荧光分子易导致其难与生物体的自体荧光进行区分从而实现对客体的标记和成像。分子探针的吸收光谱和发射光谱处于较高波段（650-900 nm ）时，其能够很好的应用于生物成像中，这是由于其对生物体具有较小的光损伤、较深的组织穿透能力以及较低的背景荧光干扰。长波长的分子探针是通过对长波长荧光染料分子进行功能性衍生设计合成的，因此长波长荧光染料是设计合成探针的基础。
（星戈瑞荧光提供CY、ICG、IR、FITC、RB等多种荧光染料）
荧光染料 |
Ex（nm） |
Em（nm） |
FITC |
490 |
525 |
TRITC |
547 |
572 |
Cy2 |
489 |
506 |
Cy3 |
555 |
570 |
Cy5 |
646 |
620 |
Cy5.5 |
675 |
694 |
Cy7 |
750 |
773 |
Calcein |
494 |
517 |
Rhodamine 110 |
496 |
520 |
Rhodamine B |
555 |
580 |
5-Carboxy Fluorescein |
492 |
518 |
5-FAM, SE |
492 |
520 |
6-TAMRA SE |
543 |
575 |
6-Carboxy-X-rhodamine |
568 |
590 |
Alexa TM 488 |
490 |
520 |
BODIPY |
530 |
550 |
Alexa TM 546 |
555 |
570 |
Pyronin Y |
550 |
580 |
Thiadicarbocyanine |
651 |
670 |
Alexa TM 594 |
590 |
615 |
6-Aminofluorescein |
490 |
520 |
Dansyl chloride |
337 |
492 |
Rhodamine 123 |
507 |
529 |
4-Methylumbelliferone |
385 |
502 |
5-carboxy-2,7-dichlorofluorescein |
504 |
529 |
5-Carboxynapthofluorescein |
512 |
568 |
5-Carboxytetramethylrhodamine (5-TAMRA) |
542 |
568 |
5-FAM (5-Carboxyfluorescein) |
492 |
518 |
5-ROX (carboxy-X-rhodamine) |
567 |
591 |
5-TAMRA (5-Carboxytetramethylrhodamine) |
548 |
552 |
Acriflavin |
436 |
520 |
Alexa Fluor 350™ |
346 |
442 |
Alexa Fluor 430™ |
431 |
540 |
Alexa Fluor 488™ |
492 |
520 |
