大多数非磺化花青的衍生物（酰肼和胺的盐酸盐除外）的水溶性都很低，当这些分子用于生物分子标记时，为了能够有效的发生反应，必须使用有机助溶剂（DMF或DMSO的5-20％）。 首先将花青染料溶解在有机溶剂中； 然后在适当的极性缓冲液中稀释再使用。
Cy5 NHS ester 是用于标记肽、蛋白质和核苷酸中的氨基的活性染料。这种染料需要少量的有机共溶剂（如DMF或DMSO）用于标记反应。该试剂是非常可贵的有效标记的可溶性蛋白以及各种肽和核苷酸的试剂。
CY叠氮活性染料标记反应： NHS ester和带NH2的蛋白、高分子和药物分子连接 maleimide和带SH的蛋白、高分子和药物分子或生物分子连接 amine和带NHS的蛋白、高分子和药物分子或小分子连接 叠氮和带炔基的蛋白、高分子和小分子 TZ可以和带TCO反应
Cy染料和磺化Cy染料（sulfo-Cy）相比，这两类染料有相同的骨架结构，因此它们具有几乎一样的荧光谱图和荧光灵敏度，在大多数情况下可以交换使用。
有机荧光染料：包括花菁染料，花酰亚胺，螺吡喃，氟硼二吡咯，香豆素等。不同的荧光染料性质差异较大，例如光谱性质、溶解性、稳定性以及聚集性能等。 今天星戈瑞小编给大家分享：荧光染料的功能化的那些事？
CY系列花菁染料大多属于近红外荧光染料它们的吸收和发射光谱区位于550-1200nm处,在这个光谱区域，玻璃、聚丙烯酰胺凝胶基质和生物化学杂质的荧光背景都很弱，信噪比很高，而且它们有着很高的摩尔吸光系数和良好的荧光特性，因此荧光检测的灵敏度很高。
荧光成像技术广泛地应用于生物医学研究。相比于常用的可见光以及近红外一区（NIR-I, 750-900 nm）荧光成像技术，近红外二区（NIR-II）由于发射波长（1000-1700 nm）更长，可显著降低在穿透生物组织时的光散射及自荧光效应的影响，使探测深度更深、空间分辨率更高。
随着荧光技术的发展，有机染料的荧光检测及荧光成像已经被应用于环境、生物医学等领域。其中，花菁染料具有摩尔消光系数大、荧光量子产率高，吸收及发射波长可调范围大，可修饰位点多等特点，是有机染料中研究常见的一类。
光稳定性是有机染料应用过程中需要考虑的重要问题之一。而花菁染料的共轭链长会影响影响其光稳定性及化学稳定性。
花菁( Cyanine，简称Cy)染料是合成染料的一种，相对而言，花菁染料的合成方法简单， 并且染料的颜色及荧光可以调节，因此使用范围极为广泛，在能源、 信息存储、高能物理、环境及生物医药领域都能见到花菁染料的身影。
